Witamy serdecznie na oficjalnej stronie Zakładu Biosystemów i Miękkiej Materii!
Zapraszamy do zapoznania się z bogatą zawartością naszego serwisu, prezentującą szerokie spektrum naszych działań. W poszczególnych zakładkach odnajdą Państwo szczegółowe informacje na temat aktualnie realizowanych przez nas prac badawczych oraz osiągnięć. Z wielką przyjemnością prezentujemy również nowoczesne wyposażenie naszych pracowni w zaawansowaną aparaturę badawczą. Poniżej znajdują się także dane kontaktowe do naszych pracowników.
Pracownicy, zespoły
Strona domowa Zakładu
|
|
| Kierownik: |  |
|
prof. dr hab. Tomasz Lipniacki tel.: +48 22 826 12 81 wewn. 409 pokój: 325 e-mail: |
| Sekretariat: |
|
Agnieszka Ponarska tel.: +48 22 826 98 03 / +48 22 826 12 81 wewn. 228 pokój: 329 e-mail: / |
Do struktury Zakładu należą:
Pracownia Modelowania w Biologii i Medycynie
Kierownik: prof. dr hab. Tomasz Lipniacki |
Strona domowa |
Badania
Tematyka aktualnie prowadzonych prac:
- Niestabilność strugi cieczy, nanostrugi i nanowłókna, elektroprzędzenie biowłókien.
- Matematyczne modele ekspresji genów, dynamika peptydów i łańcuchów DNA.
- Teoria sprzężenia mechano-chemicznego w tkankach, propagacja fal nieliniowych w tkankach, procesów regulatorowych w komórce.
- Zastosowanie teorii złożoności do analizy procesu przesyłania informacji w korze mózgowej.
- Mikro-przepływy, procesy transportu w mikroskali, tworzenie się mikro emulsji, numeryczne modele procesów przepływowych w skali mikro i nano, dynamika molekularna, metoda cząstek dysypatywnych.
- Oddziaływania hydrodynamiczne skończonej liczby cząstek w przybliżeniu Stokesa.
- Symulacja procesów zachodzących w atmosferze ziemskiej, konwekcja termiczna, wpływ turbulencji i mikroskopowych oddziaływań hydrodynamicznych na procesy dyfuzji w chmurze, model eksperymentalny chmury.
- Opis matematyczny nadciekłości ze szczególnym uwzględnieniem roli wirów kwantowych.
- Efektywne współczynniki transportu, zastosowanie aproksymant Padé do opisu własności złożonych ośrodków.
- Konwekcja swobodna z przemianą fazową, badania eksperymentalne i numeryczne procesu krzepnięcia, symulacje wzrostu kryształów i procesów odlewniczych.
- Metody oceny wiarygodności symulacji numerycznych przepływów termicznych, wzorce eksperymentalne.
- Przetwarzanie obrazów w mechanice płynów, szybkie obrazowanie wideo, jednoczesny pomiar pól prędkości i temperatur (PIV & T), tomografia pojemnościowa, nieinwazyjne badania napięcia powierzchniowego.
Słowa kluczowe:
- Ekspresja genów, łańcuchy peptydowe, łańcuchy DNA, fale wapniowe w tkankach.
- Ośrodki dyspersyjne, oddziaływania hydrodynamiczne, aproksymanty Padé.
- Nanowłókna, mikroprzepływy, mikro i nano cząstki.
- Dynamika Molekularna, Dynamika Cząstek Dysypatywnych.
- Przemiany fazowe, konwekcja swobodna, metody eksperymentalne i numeryczne.
- Równania reakcji-dyfuzji, chaos, nadciekły hel, przejścia fazowe, wiry kwantowe.
- Anemometria i termometria obrazowa, stereo PIV, mikro PIV, ciekłe kryształy, analiza obrazów.
- Przepływy atmosferyczne, turbulencja w chmurze.
- Weryfikacja i uwiarygodnienie (walidacja) modeli numerycznych przepływów.
Realizowane prace doktorskie:
| Lp. | Temat | Opiekun | Doktorant |
|---|---|---|---|
| 1 | Fale i oscylacje wapnia w komórce | prof. dr hab. Bogdan Kaźmierczak pok. 310, tel. wewn. 450 |
dr inż. Sławomir Białecki specjalista pok. 328, tel. wewn. 423 |
| 2 | Modelowanie Kaskady MAPK oraz Integracja Szlaków NFkappaB/IRF/p53 | prof. dr hab. Tomasz Lipniacki pok. 325, tel. wewn. 409 |
mgr Paweł Kocieniewski starszy programista pok. 326, tel. wewn. 411 |
Proponowane tematy prac doktorskich:
| Lp. | Temat | Opiekun |
|---|---|---|
| 1 | Modelowanie zjawisk związanych z wewnątrzkomórkową gospodarką wapniową | prof. dr hab. Bogdan Kaźmierczak pok. 310, tel. wewn. 450 |
| 2 | Mathematical and numerical analysis of pattern formation during morphogenesis | prof. dr hab. Bogdan Kaźmierczak pok. 310, tel. wewn. 450 |
| 3 | Analiza ścieżek regulatorowych aktywowanych w trakcie obrony immunologicznej komórek | prof. dr hab. Bogdan Kaźmierczak pok. 310, tel. wewn. 450 |
| 4 | Mikrohydrodynamika miękkiej materii | prof. dr hab. Maria Ekiel-Jeżewska pok. 323, tel. wewn. 227 |
| 5 | Dynamics of flexible microfibers in fluids | prof. dr hab. Maria Ekiel-Jeżewska pok. 323, tel. wewn. 227 |
| 6 | Teoretyczna i eksperymentalna analiza odpowiedzi komórek na uszkodzenie DNA – model systemu regulatorowego p53 | prof. dr hab. Tomasz Lipniacki pok. 325, tel. wewn. 409 |
Osiągnięcia
Patenty
|
Numer/data zgłoszenia patentowego Ogłoszenie o zgłoszeniu patentowym |
Twórcy Tytuł Kraj i nazwa uprawnionego z patentu |
Numer patentu Ogłoszenie o udzieleniu patentu |
Plik |
|---|---|---|---|
| 24216329.3 2024-11-29 - - |
Adamiec W., Drewa T., Jundziłł A., Kowalczyk T., Kucharska M., Kwieciński P., Meger K., Meger M., Niemczyk-Soczyńska B., Pokrywczyńska M., Tomaszewski W., Urbanek-Świderska O., Zembrzycki K. A urinary drainage prosthesis for patients without a bladder and method for manufacturing itEPO, Uniwersytet Mikołaja Kopernika w Toruniu, VET-LAB Brudzew dr Piotr Kwieciński, Sieć Badawcza Łukasiewicz - Łódzki Instytut Technologiczny, Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN, Wytwórnia Sprzętu Medycznego GALMED Katarzyna Meger | - - - |
|
| 446936 2023-11-30 - - |
Adamiec W., Drewa T., Jundziłł A., Kowalczyk T., Kucharska M., Kwieciński P., Meger K., Meger M., Niemczyk-Soczyńska B., Pokrywczyńska M., Tomaszewski W., Urbanek-Świderska O., Zembrzycki K. Proteza do odprowadzenia moczu u pacjentów pozbawionych pęcherza moczowego oraz sposób jej wytwarzaniaPL, Uniwersytet Mikołaja Kopernika w Toruniu, VET-LAB Brudzew dr Piotr Kwieciński, Sieć Badawcza Łukasiewicz - Łódzki Instytut Technologiczny, Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN, Wytwórnia Sprzętu Medycznego GALMED Katarzyna Meger | - - - |
|
| 446216 2023-09-25 - - |
Pierini F., Zargarian S., Rinoldi C., Ziai Y., Nakielski P. Przewodzące nanowłókna hydrożelowe o współ przenikającej sieci (semi-IPN) do pokrywania sond neuronowych oraz sposób ich wytwarzaniaPL, Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN | - - - |
|
| PCT/EP/2022/076874 2022-09-27 WO 2023046998 2023-03-30 |
Georg-Marten L., Kowalczyk T., Błoński S., Putrinš M., Tanel T., Korczyk P. M., Kogermann K. Fibers electrospinning including microfluidics methodWO, Uniwersytet w Tartu, Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN | - - - |
|
| 440744 2022-03-24 BUP 39/2023 2023-09-25 |
Michalik R., Nakielski P. System uwalniania produktu leczniczegoPL, Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN, Robert Michalik | - - - |
|
| PCT/PL2022050004 2022-02-03 WO/2022/177454 2022-08-25 |
Nakielski P., Pawłowska S., Pruchniewski M., Urbanek-Świderska O., Pierini F. A method for obtaining injectable biocompatible drug delivery vehicles, cell carriers or combinations thereof, in the form of microscaffolds, an injectable composition containing said vehicles, and its applicationsWO, Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN | - - - |
|
| 438386 2021-07-08 BUP 02/2023 2023-01-09 |
Pierini F., Zembrzycki K., Pawłowska S., Nakielski P., Nowak M. System detekcji bazujący na świetle wstecznie odbitym do ogniskowania wiązki w szczypcach optycznych oraz sposób zwiększenia precyzji pomiaru położenia obiektu wewnątrz szczypiec optycznychPL, Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN | 245560 WUP 36/2024 2024-09-02 |
|
| 437078 2021-02-22 BUP 35/2022 2022-08-29 |
Nakielski P., Pawłowska S., Pruchniewski M., Urbanek-Świderska O., Pierini F. Sposób otrzymywania wstrzykiwalnego biokompatybilnego nośnika leków, komórek lub ich kombinacji, w postaci mikrorusztowań, kompozycja do podawania przez wstrzykiwanie zawierająca wspomniane nośniki oraz jej zastosowaniePL, Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN | 244645 WUP 08/2024 2024-02-19 |
|
| 435749 2020-10-21 BUP 17/2022 2022-04-25 |
Pierini F., Nakielski P., Rinoldi C., Pawłowska S., Ding B., Li X., Si Y. Nanoplatforma dostarczania leków na żądanie, sposób jej wytwarzania oraz zastosowaniePL, Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN | 242911 WUP 20/2023 2023-05-15 |
|
| 404667 2013-07-12 BUP 02/2015 2015-01-19 |
Andrychowski J., Frontczak-Baniewicz M.M., Czernicki Z.M., Gołąbek-Sulejczak D.A., Kowalczyk T., Kowalewski T.A., Nakielski P. Zastosowanie siatki izolacyjnej z nanowłókien polimerowych wykonanej w technologii elektroprzędzenia do wytwarzania opatrunków neuroprotekcyjnych do stosowania w zapobieganiu pourazowym zmianom w mózguPL, Warszawski Uniwersytet Medyczny, Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej PAN, Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN | 225858 WUP 05/2017 2017-05-31 |
|
| 402159 2012-12-20 BUP 13/2014 2014-06-23 |
Szczytko J., Górecka E., Vaupotic N., Madrak K., Sznajder P., Osewski P., Turski H., Pociecha D. Sposób wyznaczania wartości namagnesowania nanocząstek magnetycznych oraz urządzenie do wyznaczania wartości namagnesowania nanocząstek magnetycznychPL, Uniwersytet Warszawski | 222392 WUP 07/2016 2016-07-29 |
|
| 402004 2012-12-11 BUP 13/2014 2014-06-23 |
Lewińska D., Kupikowska-Stobba B., Chwojnowski A., Grzeczkowicz M., Łukowska E. Sposób oznaczania stężenia komórekPL, Instytut Biocybernetyki i Inżynierii Biomedycznej PAN | 223717 WUP 10/2016 2016-10-31 |
|
| 395894 2011-08-08 BUP 04/2013 2013-02-18 |
Andrychowski J., Frontczak-Baniewicz M.M., Czernicki Z.M., Gołąbek-Sulejczak D.A., Kowalczyk T., Kowalewski T.A. Zastosowanie polimerowej siatki izolacyjnej z nanowłókien polimerowych do zapobiegania bliznowaceniu po zabiegu neurochirurgicznymPL, Warszawski Uniwersytet Medyczny, Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej PAN, Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN | 226479 WUP 07/2017 2017-07-31 |
|
| 390140 2010-01-07 BUP 15/2011 2011-07-18 |
Kowalewski T.A., Lamparska D., Zembrzycki K., Kowalczyk T., Sposób wytwarzania mat z nanowłókienPL, Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN | 222733 WUP 08/2016 2016-08-31 |
|
| 362101 2003-09-11 BUP 06/2005 2005-03-21 |
Łaszkiewicz B., Kowalewski T.A., Kulpiński P., Niekraszewicz B., Czarnecki P., Rubacha M., Pęczek B., Jedrzejczak J. Sposób wytwarzania nanowłókienPL, Politechnika Łódzka | 197202 WUP 03/2008 2008-03-31 |
|
Aparatura
Proponowane doktoraty
Proponowane tematy prac doktorskich:
| Lp. | Temat | Opiekun |
|---|---|---|
| 1 | Modelowanie zjawisk związanych z wewnątrzkomórkową gospodarką wapniową | prof. dr hab. Bogdan Kaźmierczak pok. 310, tel. wewn. 450 |
| 2 | Mathematical and numerical analysis of pattern formation during morphogenesis | prof. dr hab. Bogdan Kaźmierczak pok. 310, tel. wewn. 450 |
| 3 | Analiza ścieżek regulatorowych aktywowanych w trakcie obrony immunologicznej komórek | prof. dr hab. Bogdan Kaźmierczak pok. 310, tel. wewn. 450 |
| 4 | Mikrohydrodynamika miękkiej materii | prof. dr hab. Maria Ekiel-Jeżewska pok. 323, tel. wewn. 227 |
| 5 | Dynamics of flexible microfibers in fluids | prof. dr hab. Maria Ekiel-Jeżewska pok. 323, tel. wewn. 227 |
| 6 | Teoretyczna i eksperymentalna analiza odpowiedzi komórek na uszkodzenie DNA – model systemu regulatorowego p53 | prof. dr hab. Tomasz Lipniacki pok. 325, tel. wewn. 409 |
